> Copié el archivo de configuracion y a la hora de cargarlo me aparece un
> mensaje que dice que el archivo no se encontró.

Tenés que asegurarte de que el Doxygen encuentre estos 2 
componentes:
- El archivo de configuración Doxygen, (extensión .dxg)
- Los fuentes de tu programa

Para eso tenés que darle la RUTA COMPLETA del directorio en 
donde tenés todo. Yo siempre uso el Doxygen desde la línea de 
comandos, y me paro en el directorio en donde están los fuentes 
y el archivo .dxg.


Uso de Doxygen desde la línea de comandos
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A) Procedimiento para abrir la ventana "Símbolo de sistema"
B) CD.exe al directorio de trabajo
C) Ejecución Doxygen.exe


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| A | Procedimiento para abrir la ventana "Símbolo de sistema"
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Inicio
==> Programas
    ==> Accesorios
        ==> Símbolo del sistema


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| B | CD.exe al directorio de trabajo
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CD.exe ==> [C]hange [D]irectory  ==> Cambie de Carpeta

007) Z:\>  cd /d %UserProfile%\Escritorio

  1) Z:\> C:
  2) C:\> dir
  3) C:\> cd Doc*
  4) C:\Documents and Settings> cd DIR
  4) C:\Documents and Settings\DIR> cd SubDir
  5) C:\Documents and Settings\DIR\SubDir> doxygen Tpg1.dxg

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| C | Ejecución Doxygen.exe
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